240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3581 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  100 
 
 
258 aa  516  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  98.37 
 
 
246 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  85.43 
 
 
250 aa  441  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  85.71 
 
 
253 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  72.2 
 
 
259 aa  359  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  70.37 
 
 
259 aa  354  5.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  67.76 
 
 
258 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  72.02 
 
 
234 aa  324  8.000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  46.19 
 
 
244 aa  236  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  49 
 
 
252 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  48.35 
 
 
254 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  47.52 
 
 
254 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  46.12 
 
 
257 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  49.57 
 
 
264 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  47.93 
 
 
259 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  46.5 
 
 
246 aa  225  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  48.54 
 
 
255 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  46.22 
 
 
257 aa  223  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  45.31 
 
 
246 aa  222  6e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  45.71 
 
 
248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  49.79 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  47.11 
 
 
246 aa  214  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  48.16 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  48.16 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  48.57 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  48.89 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  47.98 
 
 
248 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  44.96 
 
 
277 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  40.74 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  41.9 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  39.04 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  39.04 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  39.09 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  43.87 
 
 
255 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  39.92 
 
 
248 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  38.33 
 
 
260 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
235 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  35.02 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  34.3 
 
 
261 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.69 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  30.72 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  30.05 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  30.18 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
270 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  31.67 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  62  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  29.17 
 
 
289 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  30.06 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  29.27 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.22 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  29.25 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  29.25 
 
 
243 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  42.17 
 
 
240 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  34.81 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  32.73 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  26.37 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  41.98 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  27.41 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  31.14 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  29.55 
 
 
246 aa  52.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  29.05 
 
 
278 aa  52.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  25.25 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  25.85 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  36.36 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  36.36 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.59 
 
 
207 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  25.99 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  47.06 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
273 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  26.22 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  37.08 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1330  hypothetical protein  33.09 
 
 
218 aa  49.3  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>