41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1839 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1839  Methyltransferase type 11  100 
 
 
378 aa  765    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3775  hypothetical protein  25.9 
 
 
300 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
310 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 
320 aa  49.7  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  29.68 
 
 
216 aa  49.7  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
310 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
341 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
209 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  27.34 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 
324 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
507 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.67 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.67 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.67 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  42.67 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.67 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  29.65 
 
 
218 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  32.06 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  42.67 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.67 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  47.5 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.15 
 
 
325 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
295 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  45.24 
 
 
244 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  45.28 
 
 
291 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  43.48 
 
 
283 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1326  methyltransferase  27.55 
 
 
258 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  41.3 
 
 
241 aa  43.1  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
218 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  26.24 
 
 
229 aa  43.1  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
208 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  36.07 
 
 
347 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
264 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  41.86 
 
 
239 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  42.59 
 
 
242 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>