126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3775 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3775  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  32.45 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.98 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
310 aa  62.4  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
331 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
213 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1839  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  26.94 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  26.09 
 
 
327 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  26.94 
 
 
328 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  26.94 
 
 
328 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  26.94 
 
 
328 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
208 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  27.36 
 
 
266 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.54 
 
 
244 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3549  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.03 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  28.91 
 
 
1845 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4222  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
212 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
249 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
241 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2490  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
235 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  25.31 
 
 
310 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4494  hypothetical protein  27.21 
 
 
212 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4457  hypothetical protein  27.21 
 
 
212 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4271  hypothetical protein  27.21 
 
 
212 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4603  hypothetical protein  27.21 
 
 
212 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.964338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4508  hypothetical protein  27.21 
 
 
212 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000692373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4455  hypothetical protein  27.21 
 
 
212 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.821165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  30.63 
 
 
331 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0742  hypothetical protein  26.53 
 
 
212 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  23.81 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4108  hypothetical protein  26.53 
 
 
212 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.404315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4119  hypothetical protein  26.53 
 
 
212 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0995588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 
239 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1765  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
723 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  27.01 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
189 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
246 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  28.16 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  30 
 
 
228 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3087  methyltransferase type 11  26.76 
 
 
212 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
218 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  28.21 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
283 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  27.18 
 
 
243 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0976  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 
220 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  31.2 
 
 
207 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  25 
 
 
184 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.62 
 
 
240 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  23.08 
 
 
196 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0029  hypothetical protein  26.17 
 
 
273 aa  46.2  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.36 
 
 
260 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2029  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
249 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  hitchhiker  0.00313988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  30.1 
 
 
223 aa  45.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  29.73 
 
 
331 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_002950  PG1619  biotin synthesis protein BioC, putative  24.29 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
189 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  26.36 
 
 
252 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  24.19 
 
 
249 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  25.44 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.43 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
334 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.07 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  31.31 
 
 
216 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  27.62 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.62 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  27.62 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  27.62 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  27.62 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  27.62 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  26.17 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  25.96 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0688  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.19 
 
 
362 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  21.67 
 
 
204 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  27.89 
 
 
526 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  25 
 
 
202 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  22 
 
 
204 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  24.27 
 
 
205 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.27 
 
 
251 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 
254 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03675  hypothetical protein  27.27 
 
 
251 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.14 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2402  Methyltransferase type 11  25.47 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.14 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>