More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0825 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  54.42 
 
 		 218 aa  241  7e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  52.83 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  50.46 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  50 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  48.83 
 
 		 218 aa  191  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  44.65 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  44.81 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  42.23 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  37.56 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  39 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  40.19 
 
 		 200 aa  138  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  36.59 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  40.2 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  40.95 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  36.18 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  36.36 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  36.54 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  32.45 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  30.22 
 
 		 200 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  29.47 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  27.35 
 
 		 258 aa  74.7  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  28.5 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.19 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.4 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34303  predicted protein  29.87 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294482  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  28.25 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.4 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  27.66 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  28.11 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 247 aa  62  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  28.67 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  26.83 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  26.82 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  25.28 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  25.28 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30108  methyltransferase  29.79 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  26.2 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.78 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.66 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  34.92 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 330 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  26.06 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  24.57 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1915  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  28.8 
 
 		 305 aa  57  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  24.57 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  24.72 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  24.72 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  24.72 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  29.71 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  24.72 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  29.23 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  24.72 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  25.12 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  29.03 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.67 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  28.47 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  24 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03717  SAM-dependent methyltransferase (Eurofung)  31.25 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0172981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  27.56 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  26.85 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  29.81 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.44 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>