207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2509 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  100 
 
 		 244 aa  480  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 250 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  99.18 
 
 		 250 aa  478  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  80.74 
 
 		 244 aa  384  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  74.59 
 
 		 246 aa  360  9e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  77.93 
 
 		 248 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  58.48 
 
 		 257 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  59.73 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  52.67 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  53.85 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  55.75 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  51.85 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  52.65 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  50.82 
 
 		 257 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  52.87 
 
 		 254 aa  254  9e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  54.46 
 
 		 255 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  49.17 
 
 		 252 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  48.16 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  48.37 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  48.57 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  48.16 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  48.13 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  46.09 
 
 		 259 aa  208  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  48.85 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  46.09 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  45.19 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  46.76 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  42.23 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  42.23 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  41.25 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  44.14 
 
 		 262 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  39.84 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  43.17 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  39.92 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  42.92 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  44.19 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  38.52 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  34.6 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  28.38 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  26.94 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  31.37 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  27.48 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  28.39 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  27.63 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  26.17 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  28.98 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  26.98 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  26.67 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  28.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  28.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  28.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  26.55 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  28.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  28.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  28.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  28.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  28.98 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  33.57 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  32.9 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  26.55 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  44.12 
 
 		 810 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  32.99 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.96 
 
 		 345 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  48 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  30.18 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  28.92 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  26.39 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  30.72 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  31.69 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  37.63 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  30.3 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  32.24 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  30.3 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  30.3 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  26.67 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 217 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>