More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2886 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  100 
 
 
277 aa  573  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  30.45 
 
 
306 aa  105  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  31.17 
 
 
305 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  29.79 
 
 
275 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  27.73 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  32.31 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 
572 aa  97.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  26.12 
 
 
330 aa  96.3  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  29.62 
 
 
291 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  28.89 
 
 
318 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
286 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
267 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  28.89 
 
 
332 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  24.63 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 
310 aa  89  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  25.6 
 
 
310 aa  88.6  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  28.92 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  27.5 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  28.85 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  34.46 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26.22 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  23.75 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  23.9 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  28.5 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  25.44 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  25.68 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  27.62 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.16 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  26.19 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  26.97 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  22.57 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  24.51 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  20.7 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.46 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.75 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  23.44 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.98 
 
 
672 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
1177 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  27.93 
 
 
457 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
1177 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  27.19 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  24.74 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  28.08 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  28.77 
 
 
334 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  27.97 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  30.3 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  25 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.1 
 
 
303 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  24.88 
 
 
342 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  30.05 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  25.85 
 
 
313 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.93 
 
 
262 aa  62.4  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.45 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  34.43 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  24.48 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  26.44 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
457 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  24.48 
 
 
326 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  29.38 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  35.83 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  25.55 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.49 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1917  cytidyltransferase-like protein  21.83 
 
 
876 aa  59.3  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00878839  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  25.42 
 
 
625 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 
247 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  34.58 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  22.98 
 
 
513 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  23.05 
 
 
346 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  30.34 
 
 
371 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.35 
 
 
247 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.35 
 
 
247 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  58.9  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.49 
 
 
336 aa  58.9  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  19.68 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
1162 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  27.44 
 
 
304 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
1523 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.65 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  28.92 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.52 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  26.47 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  28.47 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>