29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3029 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  553  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.635619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 293 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 256 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  32.31 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  35.81 
 
 		 257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  36.41 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  30.08 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2547  glycosylase or SAM-dependent methyltransferase  38.5 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.999348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  32.83 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  31.76 
 
 		 868 aa  87  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  31.8 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  27.55 
 
 		 851 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.55 
 
 		 851 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.55 
 
 		 851 aa  85.5  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.55 
 
 		 851 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.55 
 
 		 851 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 		 750 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.08 
 
 		 853 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 853 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.06 
 
 		 853 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 461 aa  65.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0619  hypothetical protein  29.73 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 710 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  28 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 507 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>