156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3600 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  100 
 
 		 293 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  40.28 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  35.68 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  40.55 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  39.82 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  38.69 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3029  hypothetical protein  33.2 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.635619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  38.25 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  38.51 
 
 		 255 aa  116  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.71 
 
 		 851 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.96 
 
 		 851 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.96 
 
 		 851 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  35.96 
 
 		 851 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.92 
 
 		 851 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1919  hypothetical protein  35.75 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.596935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  37 
 
 		 853 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 750 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.68 
 
 		 853 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.68 
 
 		 853 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2547  glycosylase or SAM-dependent methyltransferase  35.53 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.999348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2736  hypothetical protein  31.69 
 
 		 868 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  31.72 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0619  hypothetical protein  28.21 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0127  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  35.92 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2563  hypothetical protein  31.88 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 710 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 		 711 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  55.1 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  41.77 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 237 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  25.17 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  36.52 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  26.88 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  55.1 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  42.31 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  56.1 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  36.49 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  53.06 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 251 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  32.22 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.6 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  30.43 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  52.38 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2558  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.96 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  47.62 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  39.68 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  47.62 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  35.71 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 216 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  50 
 
 		 706 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3493  hypothetical protein  31.25 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.3705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.3 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 1162 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  26.9 
 
 		 347 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  38.18 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  50 
 
 		 270 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  47.62 
 
 		 265 aa  45.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 275 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.73 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  30.77 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  24.85 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  43.64 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  29.37 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  48.84 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 573 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  46 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  46.81 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>