79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0632 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0632  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1981  methyltransferase type 11  48.48 
 
 		 269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  32.64 
 
 		 262 aa  139  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2737  hypothetical protein  31.69 
 
 		 305 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1148  hypothetical protein  38.1 
 
 		 357 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3349  hypothetical protein  26.83 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3685  hypothetical protein  27.81 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  29.15 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3493  hypothetical protein  31.49 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.3705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2401  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 208 aa  62  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  30.5 
 
 		 542 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 1739 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3033  hypothetical protein  34.51 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767056  hitchhiker  0.000169463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3339  hypothetical protein  30.37 
 
 		 341 aa  55.8  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3947  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1451 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1454 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1374  hypothetical protein  30.25 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3792  hypothetical protein  41.51 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0353  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 470 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.023607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0047  hypothetical protein  29.2 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1368  hypothetical protein  28.37 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  51.16 
 
 		 511 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  52.38 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  44.68 
 
 		 228 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  54.76 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1490  hypothetical protein  23.61 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  32.97 
 
 		 353 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 810 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 353 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  46.34 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  50 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5350  hypothetical protein  30.51 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5405  hypothetical protein  22.82 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.12722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4865  hypothetical protein  30.51 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  37.41 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  48.84 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3993  hypothetical protein  24.69 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  48.72 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.92 
 
 		 345 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3406  hypothetical protein  33.93 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  48.84 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.61 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  40 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  40.3 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 359 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  47.62 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.86 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 		 307 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  44.19 
 
 		 1124 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  38.55 
 
 		 253 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0929  hypothetical protein  34.88 
 
 		 172 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  38.81 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  47.5 
 
 		 233 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  38.33 
 
 		 196 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  34.78 
 
 		 237 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 212 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 194 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.22 
 
 		 229 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.18 
 
 		 243 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  46.81 
 
 		 222 aa  42  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 		 258 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1423  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 279 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 266 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>