More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0628 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  554  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0321  hypothetical protein  31.92 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0301  hypothetical protein  33.03 
 
 
240 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0275  hypothetical protein  33.64 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0255  methyltransferase type 11  30.12 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0261  hypothetical protein  33.18 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2563  hypothetical protein  32.43 
 
 
289 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0127  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
246 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0306  hypothetical protein  39.84 
 
 
133 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  44.35 
 
 
239 aa  102  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0336  hypothetical protein  39.06 
 
 
133 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  27.65 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1977  methyltransferase type 11  31.55 
 
 
359 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166112  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  24.79 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  38.66 
 
 
634 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
293 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  37 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.82 
 
 
853 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.64 
 
 
853 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.82 
 
 
853 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  57.45 
 
 
239 aa  55.8  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
851 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
851 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
851 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  36.36 
 
 
851 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
851 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  41.89 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  55.56 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  48.08 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  50.94 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  52.08 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  36.59 
 
 
238 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
750 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  44.07 
 
 
289 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  44.62 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  39.08 
 
 
810 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3345  hypothetical protein  43.14 
 
 
241 aa  52.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.833055  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  57.78 
 
 
711 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  46.15 
 
 
283 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  47.17 
 
 
241 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  51.02 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  45.45 
 
 
710 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  48.94 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  43.4 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  50 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  44.26 
 
 
320 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  60.98 
 
 
275 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  40.62 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  55.1 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  57.5 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  53.33 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1562  SAM-dependent methyltransferase  23.61 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.595614  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  51.11 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4435  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
247 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.937365  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  40 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  41.07 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  44.26 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  37.18 
 
 
511 aa  49.7  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  56.52 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
188 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 
194 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.19 
 
 
236 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  40.85 
 
 
240 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  46.27 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  44.23 
 
 
279 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  27.92 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.14 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  34.06 
 
 
228 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4893  hypothetical protein  40.79 
 
 
268 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148209  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  37.8 
 
 
274 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  41.1 
 
 
297 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.85 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  26.45 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.85 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  43.08 
 
 
225 aa  48.9  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  52.17 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  42.62 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  45.28 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.46 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  44.62 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  50 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  42.62 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  45.28 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  45.28 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  42.62 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  42.25 
 
 
247 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  51.02 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  41.51 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  46 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  30.97 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  48.89 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  48.98 
 
 
276 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  48.89 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>