More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0658 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 233 aa  480  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  37.5 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 634 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  28.47 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  38.64 
 
 		 264 aa  62  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  30 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  33.1 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 1106 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.35 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  31.94 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.35 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0924  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.86 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  26.32 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  37.3 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  24.42 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.84 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 511 aa  52  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  33.01 
 
 		 268 aa  52  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.79 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  30.37 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  26.46 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  29.46 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  38.36 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  34.71 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 415 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2836  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.65 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  44.07 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  46.27 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.8 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  32.69 
 
 		 275 aa  49.3  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  50 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7834  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 		 316 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  33.93 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  34.13 
 
 		 262 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  32.73 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.7 
 
 		 258 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 293 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 276 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.76 
 
 		 277 aa  48.5  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 207 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  33.66 
 
 		 400 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  28.47 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  28.92 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2506  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.55 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117869  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.67 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  34.31 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  24.74 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  37.7 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3965  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.83 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  26.35 
 
 		 280 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>