76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0397 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  100 
 
 
241 aa  506  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  47.32 
 
 
1082 aa  198  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  42.41 
 
 
668 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  44.16 
 
 
415 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  43.59 
 
 
198 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
223 aa  95.5  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  29.95 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  36.44 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
324 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
213 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  32.48 
 
 
233 aa  55.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
242 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
358 aa  51.6  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  37.33 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
331 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
267 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  29.79 
 
 
866 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.73 
 
 
325 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  35 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.65 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 
243 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
271 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
262 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  38.98 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  43.75 
 
 
253 aa  45.8  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  29.25 
 
 
236 aa  45.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  36.76 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
239 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
267 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
511 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  37.7 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  32.43 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  35.09 
 
 
213 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.18 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  25.4 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  28.71 
 
 
233 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
706 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  26.75 
 
 
283 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
293 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.36 
 
 
269 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 
240 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
341 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
241 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
332 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  40.98 
 
 
710 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
201 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  36.92 
 
 
243 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  33.33 
 
 
254 aa  42  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  26 
 
 
287 aa  42  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
711 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  27.43 
 
 
276 aa  42  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
187 aa  42  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  33.75 
 
 
324 aa  42  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
261 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  30.85 
 
 
246 aa  41.6  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>