39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3647 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  97.93 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  40.86 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 311 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  45.97 
 
 		 324 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  41.4 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  39.58 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 1476 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  29.47 
 
 		 870 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  28.87 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  39.24 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  39.29 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 415 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 1082 aa  52.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  27.5 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  31.69 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  30.43 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  31.36 
 
 		 668 aa  46.2  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1124 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 866 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 310 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  24.68 
 
 		 224 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 511 aa  42  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>