36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2045 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  100 
 
 
358 aa  711    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  44.38 
 
 
311 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  43.5 
 
 
296 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
324 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  41.54 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  41.03 
 
 
242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  37.2 
 
 
235 aa  90.1  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  34.62 
 
 
233 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  30.29 
 
 
213 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  30.72 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  31.07 
 
 
216 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  30.25 
 
 
280 aa  56.2  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
242 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
254 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  31.75 
 
 
222 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
241 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2348  hypothetical protein  31.03 
 
 
220 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  29.46 
 
 
1124 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
223 aa  49.3  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
415 aa  49.7  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  32.88 
 
 
240 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
238 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  32.48 
 
 
668 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 
1476 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  27.01 
 
 
238 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  29.75 
 
 
870 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  30.67 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  24.76 
 
 
181 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
198 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  31.06 
 
 
231 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  25.52 
 
 
239 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 
511 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>