88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3339 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  100 
 
 
222 aa  453  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  45 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  32.2 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  39.08 
 
 
242 aa  62  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  32.84 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  34.58 
 
 
870 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
244 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  42.86 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  41.89 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2348  hypothetical protein  36.36 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  43.94 
 
 
264 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  38.67 
 
 
240 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  40 
 
 
235 aa  55.1  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  38.1 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  31.75 
 
 
358 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  25.83 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
511 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  37.5 
 
 
181 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
507 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
254 aa  51.6  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  38.36 
 
 
1476 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  44.59 
 
 
324 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  38.16 
 
 
322 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  30.26 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  26.85 
 
 
243 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.82 
 
 
296 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
269 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  39.19 
 
 
706 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  39.71 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 
341 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
254 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.07 
 
 
219 aa  45.4  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  36.05 
 
 
279 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
257 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
305 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 
192 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 
341 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  33.78 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4394  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  30.12 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  32.45 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  35.53 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  35.82 
 
 
239 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  35.38 
 
 
1082 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  38.16 
 
 
711 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
215 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  42.59 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
274 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
710 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  38.64 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0410  Methyltransferase type 11  28.96 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.77 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.77 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  32.81 
 
 
311 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  47.62 
 
 
284 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 
272 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  29.07 
 
 
1124 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.53 
 
 
345 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
237 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32 
 
 
293 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.84 
 
 
232 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  38.18 
 
 
270 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
271 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 
254 aa  42  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
252 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
252 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
249 aa  41.6  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  46 
 
 
247 aa  41.6  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>