60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0725 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  100 
 
 
668 aa  1329    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  44.39 
 
 
1082 aa  183  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  42.41 
 
 
241 aa  150  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  40.37 
 
 
198 aa  117  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
415 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
223 aa  92.8  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
866 aa  66.6  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
324 aa  64.7  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
238 aa  64.3  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
296 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  33.93 
 
 
311 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
213 aa  59.3  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
235 aa  58.9  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  31.46 
 
 
227 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
237 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
1476 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
358 aa  49.3  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
283 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  33.06 
 
 
280 aa  48.9  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  35.94 
 
 
240 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  41.79 
 
 
511 aa  48.5  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  46.27 
 
 
255 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  56.82 
 
 
1632 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  56.82 
 
 
1806 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  39.66 
 
 
262 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  45.16 
 
 
597 aa  47.4  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  30.56 
 
 
233 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  60 
 
 
461 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
322 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  57.5 
 
 
2342 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
242 aa  45.8  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  57.5 
 
 
2342 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  63.64 
 
 
227 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1185  hypothetical protein  52.5 
 
 
138 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.84 
 
 
916 aa  46.6  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3867  hypothetical protein  36 
 
 
296 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293011  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  60 
 
 
644 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  60.61 
 
 
287 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  34.26 
 
 
213 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
242 aa  45.8  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  58.97 
 
 
2796 aa  45.8  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  38.33 
 
 
237 aa  45.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  60.61 
 
 
120 aa  45.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  47.46 
 
 
849 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3152  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
254 aa  45.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.23938  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.91 
 
 
272 aa  45.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  60.61 
 
 
115 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
243 aa  45.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
324 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
192 aa  45.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  43.75 
 
 
281 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
242 aa  44.7  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
270 aa  44.3  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  29.85 
 
 
226 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  35 
 
 
265 aa  44.3  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1767  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.8 
 
 
350 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2379  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.8 
 
 
350 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
241 aa  44.3  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2882  hypothetical protein  29.84 
 
 
223 aa  44.3  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  44.9 
 
 
251 aa  44.3  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>