112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0320 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  100 
 
 		 1082 aa  2221    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  35.24 
 
 		 695 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  37.07 
 
 		 686 aa  429  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.52 
 
 		 957 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  46.86 
 
 		 955 aa  362  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  45.78 
 
 		 787 aa  341  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  44.6 
 
 		 383 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  35.89 
 
 		 1247 aa  318  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.13 
 
 		 734 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  42.49 
 
 		 734 aa  313  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  42.33 
 
 		 1077 aa  305  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  42.54 
 
 		 363 aa  302  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  44.38 
 
 		 358 aa  299  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  44.22 
 
 		 358 aa  297  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  43.64 
 
 		 358 aa  290  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  39.34 
 
 		 377 aa  288  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  43.35 
 
 		 358 aa  288  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  42.61 
 
 		 358 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  36.16 
 
 		 358 aa  277  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  39.94 
 
 		 843 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 		 882 aa  273  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  41.3 
 
 		 381 aa  273  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  37.19 
 
 		 368 aa  263  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  37.09 
 
 		 361 aa  247  8e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  40.87 
 
 		 317 aa  245  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  40.87 
 
 		 317 aa  245  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  36.94 
 
 		 366 aa  230  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  34.66 
 
 		 751 aa  224  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  34.66 
 
 		 751 aa  224  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.8 
 
 		 364 aa  224  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.03 
 
 		 357 aa  211  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  47.32 
 
 		 241 aa  198  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  44.39 
 
 		 668 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  31.98 
 
 		 372 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  42.42 
 
 		 198 aa  139  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  40.36 
 
 		 415 aa  134  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  35.26 
 
 		 223 aa  102  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 238 aa  100  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.38 
 
 		 916 aa  100  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 828 aa  82.4  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0640  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.42 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.7378  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.47 
 
 		 1366 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 846 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  27.2 
 
 		 631 aa  77  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  27.67 
 
 		 513 aa  76.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.34 
 
 		 1161 aa  74.7  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.51 
 
 		 588 aa  72.8  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.97 
 
 		 1162 aa  70.1  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  21.58 
 
 		 381 aa  70.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  21.32 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 227 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 1236 aa  67.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  34 
 
 		 324 aa  67  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 311 aa  67  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 		 1301 aa  66.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 213 aa  64.3  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2389  hypothetical protein  25.71 
 
 		 357 aa  63.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  25.1 
 
 		 606 aa  63.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  25.08 
 
 		 866 aa  62.4  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 666 aa  62  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3152  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 254 aa  59.7  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.23938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 324 aa  55.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 		 1239 aa  55.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  28.24 
 
 		 233 aa  54.7  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 242 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  18.99 
 
 		 746 aa  52.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 242 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  26.06 
 
 		 1209 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 581 aa  51.2  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 201 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  27.84 
 
 		 287 aa  50.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88532  predicted protein  23.57 
 
 		 3608 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.478087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 270 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  22.3 
 
 		 384 aa  50.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  24.11 
 
 		 1182 aa  50.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0989  Chromosome segregation ATPase-like protein  26.86 
 
 		 818 aa  50.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.545373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 1476 aa  50.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1146  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 256 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  49.3  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.25 
 
 		 240 aa  49.3  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1633  hypothetical protein  25.24 
 
 		 609 aa  48.5  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 322 aa  48.5  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  26.7 
 
 		 245 aa  48.5  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  38.03 
 
 		 245 aa  48.5  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 228 aa  47.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  27.19 
 
 		 189 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1367  hypothetical protein  25.55 
 
 		 220 aa  47.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  36.05 
 
 		 400 aa  46.6  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  30.91 
 
 		 181 aa  47.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 249 aa  47  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  30.51 
 
 		 254 aa  46.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 242 aa  46.2  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 284 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 211 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  28.26 
 
 		 351 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  35.59 
 
 		 237 aa  46.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  27.14 
 
 		 1193 aa  45.8  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 240 aa  45.8  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>