231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4197 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 846 aa  1736    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  39.23 
 
 		 1236 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  34.67 
 
 		 828 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 461 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.91 
 
 		 916 aa  138  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.75 
 
 		 1366 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.13 
 
 		 643 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  28.9 
 
 		 793 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  29.11 
 
 		 823 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.19 
 
 		 443 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.6 
 
 		 643 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 643 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  32.08 
 
 		 581 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  31.21 
 
 		 751 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.59 
 
 		 1162 aa  109  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  31.21 
 
 		 751 aa  110  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.23 
 
 		 588 aa  106  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.94 
 
 		 643 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.69 
 
 		 1161 aa  104  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2576  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 406 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731131  normal  0.452849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  29.13 
 
 		 513 aa  103  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0039  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 399 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 1247 aa  99.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 		 1264 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  27.84 
 
 		 606 aa  98.2  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2777  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 406 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  34.8 
 
 		 695 aa  94  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.53 
 
 		 666 aa  94  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  31.23 
 
 		 686 aa  87.4  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  27.76 
 
 		 631 aa  83.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 703 aa  80.9  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0126  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 699 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699661  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0640  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.44 
 
 		 519 aa  78.6  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.7378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 1301 aa  77.4  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  29.39 
 
 		 1082 aa  72.4  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  29.44 
 
 		 440 aa  67  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5426  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 		 396 aa  60.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 364 aa  60.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  43.06 
 
 		 849 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  27.4 
 
 		 423 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 367 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1077  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 		 325 aa  57  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.508973  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  21.25 
 
 		 765 aa  57.4  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 414 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  40 
 
 		 1632 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40 
 
 		 1806 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2078  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 396 aa  56.6  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 		 743 aa  56.2  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  28.57 
 
 		 503 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 		 410 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 394 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  36.49 
 
 		 592 aa  55.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  26.28 
 
 		 366 aa  55.1  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.34 
 
 		 419 aa  55.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 365 aa  54.7  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  28.47 
 
 		 597 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 381 aa  53.9  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  39.44 
 
 		 2796 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 384 aa  53.9  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 362 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  45.83 
 
 		 361 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 375 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 418 aa  53.5  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 410 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02930  glycosyltransferase  31.17 
 
 		 386 aa  52.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 		 396 aa  52.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 1067 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.64 
 
 		 366 aa  52.4  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.21 
 
 		 375 aa  52  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 		 857 aa  52.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1880 aa  52  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 364 aa  52.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 425 aa  52  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 363 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 385 aa  52  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  28.05 
 
 		 650 aa  51.6  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  36.11 
 
 		 2342 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  36.11 
 
 		 2342 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 		 352 aa  51.6  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 376 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 		 1152 aa  51.6  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 415 aa  51.6  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  35.23 
 
 		 1152 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 426 aa  51.2  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 414 aa  51.2  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 411 aa  50.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 400 aa  50.8  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 457 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 		 396 aa  50.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 379 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 415 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 872 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>