30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4195 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  100 
 
 		 631 aa  1306    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.8 
 
 		 666 aa  278  3e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  31.65 
 
 		 606 aa  266  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.25 
 
 		 588 aa  171  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  25.78 
 
 		 581 aa  162  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.1 
 
 		 1366 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.83 
 
 		 1162 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.95 
 
 		 916 aa  100  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 828 aa  89.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  28.46 
 
 		 513 aa  88.2  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.83 
 
 		 1161 aa  87.4  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 1236 aa  87  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  30.74 
 
 		 695 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 846 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.85 
 
 		 1030 aa  80.9  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 1301 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  30.71 
 
 		 686 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.87 
 
 		 751 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  28.87 
 
 		 751 aa  77  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 1082 aa  72.8  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1172  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.77 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.535151  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0866  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.69 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000198306 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0640  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.18 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.7378  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1351  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25 
 
 		 326 aa  66.6  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.054714  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  25.39 
 
 		 972 aa  61.6  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4196  putative glycosyltransferase  24.62 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.97214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0076  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.52 
 
 		 385 aa  57  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.39731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  23.86 
 
 		 1003 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4277  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.13 
 
 		 359 aa  47  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.52167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  22.01 
 
 		 1386 aa  44.3  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>