19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1351 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1351  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 326 aa  646    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.054714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4196  putative glycosyltransferase  36.11 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.97214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1172  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  32.09 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.535151  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  29.2 
 
 		 1003 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  29.71 
 
 		 972 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.08 
 
 		 1030 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.08 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.62 
 
 		 588 aa  99  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 1044 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  27.51 
 
 		 581 aa  96.3  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4277  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  33.51 
 
 		 359 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.52167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.83 
 
 		 1366 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  27.81 
 
 		 606 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 		 1386 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 666 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2452  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.09 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  25 
 
 		 631 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0076  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.45 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.39731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0866  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.83 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000198306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>