212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0194 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  100 
 
 		 1030 aa  2119    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  30.3 
 
 		 1003 aa  266  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  29.43 
 
 		 972 aa  254  7e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 1486 aa  148  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 		 1334 aa  141  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  35.88 
 
 		 1991 aa  138  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 710 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 		 783 aa  130  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 717 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 717 aa  128  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 586 aa  125  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 		 617 aa  125  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 		 746 aa  125  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 		 1152 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 		 576 aa  124  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 		 1152 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 		 733 aa  124  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 709 aa  124  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 709 aa  124  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 796 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.55 
 
 		 610 aa  122  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 765 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 531 aa  121  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 808 aa  121  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 1067 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 723 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 		 1759 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 728 aa  119  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 880 aa  118  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 		 832 aa  118  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 		 662 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  29.41 
 
 		 810 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 		 555 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 729 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 		 988 aa  115  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 775 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 		 526 aa  115  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 784 aa  114  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 748 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 996 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.88 
 
 		 1644 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.88 
 
 		 1644 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 721 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  31.14 
 
 		 305 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 		 551 aa  111  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 		 635 aa  111  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 1359 aa  111  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 632 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1172  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  31.54 
 
 		 325 aa  110  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.535151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 653 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 625 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 625 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1351  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.08 
 
 		 326 aa  110  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.054714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  30.45 
 
 		 632 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.19 
 
 		 809 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 1275 aa  110  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 983 aa  109  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 1509 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 790 aa  109  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 		 602 aa  109  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 652 aa  108  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4196  putative glycosyltransferase  28.37 
 
 		 321 aa  108  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.97214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 		 794 aa  107  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.87 
 
 		 2401 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 		 551 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 684 aa  106  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 742 aa  105  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  30.86 
 
 		 1182 aa  105  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 		 670 aa  103  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 742 aa  102  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 		 684 aa  102  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 		 958 aa  101  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 		 732 aa  100  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 742 aa  100  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 		 725 aa  99.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 625 aa  99.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.39 
 
 		 588 aa  98.6  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 		 958 aa  97.8  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 539 aa  97.8  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.29 
 
 		 1561 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 658 aa  96.3  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  28.08 
 
 		 731 aa  95.5  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 525 aa  94.7  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 857 aa  93.2  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 		 725 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.29 
 
 		 427 aa  91.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 1044 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 430 aa  87  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1974  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 		 853 aa  86.7  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 1198 aa  85.5  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 581 aa  85.5  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 510 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2262  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0285994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 1188 aa  81.6  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  25.85 
 
 		 631 aa  81.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 		 1386 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 1193 aa  74.7  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  27.5 
 
 		 783 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 1297 aa  73.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>