32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0212 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 588 aa  1213    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  43.8 
 
 		 581 aa  462  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  25.25 
 
 		 631 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 		 666 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  23.66 
 
 		 606 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 846 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 828 aa  104  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0866  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.55 
 
 		 317 aa  99.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000198306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.63 
 
 		 1366 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1351  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.62 
 
 		 326 aa  99  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.054714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.39 
 
 		 1030 aa  98.6  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4196  putative glycosyltransferase  27.72 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.97214 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1172  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.23 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.535151  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 1236 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  25.63 
 
 		 972 aa  80.1  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  26.92 
 
 		 686 aa  75.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  26.12 
 
 		 513 aa  73.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.12 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 1082 aa  70.9  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 1386 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  26.79 
 
 		 695 aa  63.9  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4277  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.46 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.52167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 1044 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  22.56 
 
 		 1003 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.51 
 
 		 751 aa  61.6  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0076  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.6 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.39731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  24.51 
 
 		 751 aa  60.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.75 
 
 		 916 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.03 
 
 		 1162 aa  51.2  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 793 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  25 
 
 		 823 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  24.82 
 
 		 1301 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>