33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1432 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 581 aa  1204    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.8 
 
 		 588 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  25.78 
 
 		 631 aa  163  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.27 
 
 		 1366 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  25.14 
 
 		 606 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  34.73 
 
 		 828 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 846 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 		 1236 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1351  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.51 
 
 		 326 aa  96.3  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.054714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4196  putative glycosyltransferase  30.1 
 
 		 321 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.97214 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0866  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.48 
 
 		 317 aa  87.4  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000198306 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.84 
 
 		 1030 aa  85.5  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  27.8 
 
 		 686 aa  84.3  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  25.97 
 
 		 972 aa  83.2  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.26 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1172  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.37 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.535151  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  29.07 
 
 		 695 aa  73.9  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.02 
 
 		 916 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.33 
 
 		 1162 aa  70.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  24.02 
 
 		 1003 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 1386 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.39 
 
 		 1161 aa  66.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  32.74 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4277  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.43 
 
 		 359 aa  60.1  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.52167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 1044 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.13 
 
 		 751 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  29.13 
 
 		 751 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  25.97 
 
 		 823 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  29.1 
 
 		 793 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 1301 aa  50.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  25 
 
 		 1082 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2452  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.28 
 
 		 418 aa  48.9  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>