16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4277 on replicon NC_007801
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007801  Jann_4277  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  100 
 
 		 359 aa  731    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.52167 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0076  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  35.34 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.39731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1351  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.51 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.054714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4196  putative glycosyltransferase  30.26 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.97214 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  31.21 
 
 		 1003 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  27.42 
 
 		 972 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 666 aa  68.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2452  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.94 
 
 		 418 aa  67  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.46 
 
 		 588 aa  63.9  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1172  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.79 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.535151  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  32.18 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  24.46 
 
 		 606 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.69 
 
 		 1030 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  25.13 
 
 		 631 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 		 1386 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>