29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4462 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  100 
 
 		 606 aa  1252    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.93 
 
 		 666 aa  310  4e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  31.65 
 
 		 631 aa  267  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 581 aa  128  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 588 aa  118  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.06 
 
 		 1366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 		 846 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 1236 aa  90.1  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 		 828 aa  89.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1351  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.81 
 
 		 326 aa  87  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.054714  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.13 
 
 		 1162 aa  86.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.43 
 
 		 1161 aa  84  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.67 
 
 		 916 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0866  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.64 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000198306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4196  putative glycosyltransferase  25.54 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.97214 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.09 
 
 		 1030 aa  66.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  27.34 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  25.42 
 
 		 751 aa  60.8  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.42 
 
 		 751 aa  60.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  25.1 
 
 		 1082 aa  60.1  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  27.56 
 
 		 972 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  25.81 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  26.07 
 
 		 823 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4277  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.46 
 
 		 359 aa  56.2  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.52167 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  27.18 
 
 		 1003 aa  55.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1172  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.89 
 
 		 325 aa  48.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.535151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  22.34 
 
 		 305 aa  47.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2452  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.13 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  20.87 
 
 		 513 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>