53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0519 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  100 
 
 		 686 aa  1384    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  59.71 
 
 		 695 aa  819    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  36.85 
 
 		 1082 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  48.84 
 
 		 955 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  46.94 
 
 		 734 aa  343  7e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.64 
 
 		 734 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  46.54 
 
 		 383 aa  336  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  46.58 
 
 		 787 aa  330  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  47.21 
 
 		 1247 aa  324  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  46.24 
 
 		 1077 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  44.94 
 
 		 363 aa  318  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.37 
 
 		 957 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  45.94 
 
 		 377 aa  309  9e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  44.35 
 
 		 751 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  44.35 
 
 		 751 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  40.73 
 
 		 368 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  41.48 
 
 		 882 aa  263  6.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  40.23 
 
 		 843 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.89 
 
 		 358 aa  251  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  37.03 
 
 		 381 aa  248  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  35.73 
 
 		 358 aa  243  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  35.96 
 
 		 358 aa  241  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.4 
 
 		 357 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  37.89 
 
 		 364 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  34.83 
 
 		 358 aa  234  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  34.55 
 
 		 358 aa  234  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  34.55 
 
 		 358 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  34.53 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  34.44 
 
 		 317 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  34.44 
 
 		 317 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  31.42 
 
 		 366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  31.18 
 
 		 372 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.33 
 
 		 1366 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0640  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.57 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.7378  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  30 
 
 		 916 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  28.82 
 
 		 513 aa  96.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.71 
 
 		 1161 aa  90.1  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 		 846 aa  87.8  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  26.68 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.31 
 
 		 1162 aa  84.3  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 828 aa  84  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  26.17 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 1236 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  30.71 
 
 		 631 aa  78.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 588 aa  75.5  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 666 aa  72.4  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 1301 aa  65.1  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  27.34 
 
 		 606 aa  64.7  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  30.65 
 
 		 793 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  28.44 
 
 		 823 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4007  polysaccharide biosynthesis protein  65.12 
 
 		 47 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3365  hypothetical protein  28.75 
 
 		 348 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.792231  normal  0.845884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>