14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3365 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3365  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  716    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.792231  normal  0.845884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3361  hypothetical protein  48.6 
 
 		 355 aa  326  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.148862 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1633  hypothetical protein  24.76 
 
 		 609 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47966  predicted protein  24.67 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.667552  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.29 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  18.34 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  18.05 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  19.81 
 
 		 695 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  22.6 
 
 		 576 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 734 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  28.75 
 
 		 686 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.59 
 
 		 734 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  27.85 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.66 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>