149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3634 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
1044 aa  2115    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  42.42 
 
 
1386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.72 
 
 
1366 aa  297  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  37.07 
 
 
849 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  33.24 
 
 
1067 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
856 aa  161  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
3301 aa  147  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  36.64 
 
 
305 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 
414 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
671 aa  142  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
857 aa  135  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  30.81 
 
 
1644 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  30.81 
 
 
1644 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
725 aa  130  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
867 aa  129  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  35.69 
 
 
2342 aa  125  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  35.69 
 
 
2342 aa  125  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  32.55 
 
 
787 aa  122  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
404 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
756 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  32.75 
 
 
2796 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.93 
 
 
1806 aa  116  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  32.95 
 
 
916 aa  115  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
392 aa  115  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
392 aa  114  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  31.58 
 
 
1632 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  38.61 
 
 
521 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  41.55 
 
 
535 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
774 aa  111  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 
401 aa  110  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 
1247 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
791 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
389 aa  107  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  35.47 
 
 
1003 aa  104  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  43.64 
 
 
1152 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  43.64 
 
 
1152 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  27.75 
 
 
383 aa  102  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  32.36 
 
 
373 aa  100  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  32.23 
 
 
972 aa  99.4  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1172  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.05 
 
 
325 aa  99.4  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.535151  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
995 aa  97.8  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  41.22 
 
 
597 aa  97.8  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1351  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.63 
 
 
326 aa  97.8  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.054714  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  47.29 
 
 
294 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
873 aa  94.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4196  putative glycosyltransferase  28.19 
 
 
321 aa  94  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.97214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  45.38 
 
 
294 aa  94  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  45.38 
 
 
294 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
987 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
872 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
616 aa  92.8  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
1035 aa  92  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
1059 aa  92  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
665 aa  90.1  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.73 
 
 
1030 aa  87.4  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
679 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  33.56 
 
 
746 aa  86.7  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
624 aa  85.1  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
1317 aa  84.7  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
379 aa  84.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  34.27 
 
 
223 aa  83.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
377 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  31.78 
 
 
518 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
1313 aa  82  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
332 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
357 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
1322 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
374 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
995 aa  75.1  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  37.69 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  42.48 
 
 
255 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  36.92 
 
 
361 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
359 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  35.14 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
1264 aa  72  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 
1476 aa  71.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  32.47 
 
 
235 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
359 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.81 
 
 
916 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  28.66 
 
 
678 aa  66.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
680 aa  65.1  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  53.45 
 
 
399 aa  64.3  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 
588 aa  63.2  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  62.4  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  47.14 
 
 
227 aa  62  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
1236 aa  60.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 
882 aa  60.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  45.71 
 
 
137 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  37.61 
 
 
361 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  43.59 
 
 
115 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 
581 aa  59.7  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  45.71 
 
 
137 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0297  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
411 aa  58.2  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  40.79 
 
 
1302 aa  57.4  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
1075 aa  57.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  27.1 
 
 
523 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
995 aa  56.6  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  25.57 
 
 
394 aa  56.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>