41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3716 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  39.35 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 296 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 311 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 324 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 358 aa  87.8  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 1082 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 		 1476 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  28.16 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  34.21 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.17 
 
 		 870 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 511 aa  51.6  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  28.87 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 415 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 866 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  31.58 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  30.56 
 
 		 668 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  24.41 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2563  hypothetical protein  37.74 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1124 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  26.61 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  28.24 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  30.67 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_342  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase, methyltransferase type 12  38.18 
 
 		 255 aa  42  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0343727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0399  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  45 
 
 		 255 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0378  methyltransferase type 11  45 
 
 		 255 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00156653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>