54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2387 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  100 
 
 		 238 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  42.76 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 415 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  36.96 
 
 		 1082 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  32.51 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  29.71 
 
 		 668 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  31.03 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 213 aa  62  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 866 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  32.03 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  31.33 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3545  hypothetical protein  36.76 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 511 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 706 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  25.83 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 358 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  33.82 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  29.46 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  28.32 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 		 345 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  25.37 
 
 		 870 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  26.26 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2563  hypothetical protein  51.22 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  25.89 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 317 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1124 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  25.89 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  27.68 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  47.5 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 1037 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  27.68 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  25 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  39.06 
 
 		 201 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 		 333 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  29.1 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  28.12 
 
 		 311 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>