More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0636 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  33.74 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 		 1476 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  37.07 
 
 		 280 aa  75.1  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  45 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 511 aa  72.8  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  32.84 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  46.48 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 322 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  45.71 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  37.6 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  31.62 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3844  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 305 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  38.03 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  38.03 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  38.03 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  53.7 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  33.83 
 
 		 711 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  38.03 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  35.14 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  31.3 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 710 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  48.94 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  44.07 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  40.28 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  32.76 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  41.82 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  46.3 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  48.08 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 288 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000027512  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  31.78 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4065  methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  0.0815821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 331 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.36 
 
 		 870 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  44.23 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  34.34 
 
 		 318 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.54 
 
 		 764 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3615  methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 266 aa  52.4  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134512 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.63 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  32.48 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0410  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 276 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.68 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  29.37 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  42.59 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  29.76 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 293 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  35.11 
 
 		 392 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 706 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  30 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 		 785 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  26.83 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  39.06 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>