48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2882 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2882  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  456  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00222984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.86 
 
 		 345 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  26.84 
 
 		 681 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 1523 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  29.63 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  32.73 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  24.78 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  23.53 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  28.19 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 		 1162 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  24.79 
 
 		 256 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  29.84 
 
 		 668 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  26.83 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  23.93 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 		 1523 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.67 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 356 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  26.11 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 		 323 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  24.43 
 
 		 323 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  25.13 
 
 		 310 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  25.49 
 
 		 488 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  24.69 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  23.6 
 
 		 239 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  24.22 
 
 		 241 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  26.5 
 
 		 308 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  32.11 
 
 		 197 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 255 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  28.48 
 
 		 249 aa  42  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 212 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  23.68 
 
 		 229 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 298 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2359  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.26 
 
 		 412 aa  42  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  23.03 
 
 		 229 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  23.03 
 
 		 229 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 324 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>