More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1285 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  65.02 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  36.45 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  34.91 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  34.32 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  33.73 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  33.33 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  33.14 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  33.54 
 
 		 228 aa  99  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  40.24 
 
 		 581 aa  98.6  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 996 aa  98.6  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  31.48 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 		 1162 aa  91.3  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  34.76 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 1340 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  32.51 
 
 		 1523 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  29.94 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  25.98 
 
 		 681 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  30.11 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 1523 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 		 1314 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  32.42 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 		 1287 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  35.1 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  36.53 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  32.56 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  32.32 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.42 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  32.53 
 
 		 785 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 1312 aa  72.4  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0661  Methyltransferase type 12  27.18 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.259712  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  28.66 
 
 		 543 aa  68.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0639  Methyltransferase type 12  27.18 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  33.77 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  32.88 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 353 aa  65.5  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  32 
 
 		 746 aa  65.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 1256 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  30.25 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  26.21 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  30.73 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  30.73 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  35.26 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4067  methionine biosynthesis protein MetW  30.26 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  34.62 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  32.87 
 
 		 323 aa  62  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  34.13 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  30.25 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.44 
 
 		 634 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  27.57 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  28.75 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  28.95 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  27.1 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3033  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 504 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.01 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  29.65 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.1 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3058  methionine biosynthesis MetW  27.64 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1459  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  27.5 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  26.88 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  39.2 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  39.1 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  39.1 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  35.77 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.14 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  28.29 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  30.23 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>