More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3134 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 254 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  39.85 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  35.53 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  32 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  32.46 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  32.61 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 511 aa  68.6  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 706 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7834  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.25 
 
 		 764 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  37.97 
 
 		 1476 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  28.11 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.71 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  27.95 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.72 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  31.09 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  34.04 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 358 aa  53.9  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  22.38 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.15 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.04 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3821  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 203 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  48.94 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 198 aa  52  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  26.28 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  24.56 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  52.17 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 634 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.29 
 
 		 282 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  24.38 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  30.63 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  27.33 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.98 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  23.2 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.69 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  22.39 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2391  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000289093  hitchhiker  0.0000349979 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 866 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 507 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3152  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.23938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  33.67 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  44.07 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1269  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  38.89 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  47.06 
 
 		 206 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  28.7 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  45.76 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2729  Methyltransferase type 11  24.63 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3856  hypothetical protein  28.28 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67552  normal  0.498735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  47.83 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>