More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1269 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1269  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  49.25 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 261 aa  138  7e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0386  methyltransferase  33.33 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3751  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 243 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  26.2 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0738  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.9 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  31.25 
 
 		 287 aa  62  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  24.68 
 
 		 317 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.67 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.120652  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  38.05 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0806  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.3 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.622934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.86 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf339  predicted O-methyltransferase  28.91 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  33.05 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  31.34 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1295  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.5 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.82 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  29.63 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.88 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.05 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  29.84 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.22 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.22 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  29.2 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1676  putative methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine (SAM)-MTase protein  27.91 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  35.34 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0855  methyltransferase type 11  24.83 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.233642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 363 aa  55.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0217452 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  30.17 
 
 		 313 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  31.58 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  29.14 
 
 		 168 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  30.06 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.2 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.28 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  29.1 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.12 
 
 		 351 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  28.49 
 
 		 392 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  33.93 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.56 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.47 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.63 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  30.49 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  30.54 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  29.14 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>