More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2330 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  518  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  25.25 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  25.23 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  32.81 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  39.8 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
282 aa  72  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  31.39 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  30.71 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  33.33 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  24.42 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.69 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  31.2 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.65 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
293 aa  68.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.64 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  32 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.32 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.32 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.01 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  23.3 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.16 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2710  demethylmenaquinone methyltransferase  28.71 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  28.46 
 
 
315 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  27.83 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  30.4 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.32 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  30.69 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
201 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  23.03 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.17 
 
 
282 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  30.47 
 
 
325 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  30 
 
 
342 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  34.26 
 
 
240 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  25 
 
 
293 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  31.97 
 
 
255 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.59 
 
 
253 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
237 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  24.24 
 
 
242 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 
254 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
275 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.66 
 
 
202 aa  62  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 
247 aa  62  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0336  Methyltransferase type 11  26.01 
 
 
259 aa  62  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0390472  normal  0.038594 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
240 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.27 
 
 
245 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  24.61 
 
 
348 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  27.46 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  27.83 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
205 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.03 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  31.09 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.91 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.09 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.37 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.04 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0321  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  24.18 
 
 
629 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.97 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.67 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  37.63 
 
 
209 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  25.95 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.19 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  29.86 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.46 
 
 
299 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  26.2 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>