More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0490 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  100 
 
 
222 aa  429  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  45.19 
 
 
237 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  41.03 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  43.56 
 
 
243 aa  161  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  42.41 
 
 
237 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  40.68 
 
 
239 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  41.1 
 
 
255 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  45.21 
 
 
289 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  42.68 
 
 
237 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  40.25 
 
 
240 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 
241 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  43.83 
 
 
240 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  41.45 
 
 
243 aa  147  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  39.41 
 
 
238 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  42.41 
 
 
239 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  37.87 
 
 
241 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  44.07 
 
 
251 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  36.48 
 
 
241 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  37.3 
 
 
249 aa  135  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  37.55 
 
 
243 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  37.55 
 
 
243 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  37.55 
 
 
243 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  36.53 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  34.9 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  38.27 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  30.72 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  30.58 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  26.63 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  29.11 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  36.05 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.59 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.86 
 
 
293 aa  68.2  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  34.36 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.86 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  42.28 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  46 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  36.07 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
1314 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  28.37 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 
551 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  25.47 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  37.33 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  29.22 
 
 
293 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.04 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  42.99 
 
 
299 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.45 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
301 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  34.17 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.12 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.85 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.78 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
252 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  40.54 
 
 
254 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.06 
 
 
238 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  50 
 
 
197 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.45 
 
 
232 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  33.56 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
229 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  42.2 
 
 
711 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
281 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
235 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  40.19 
 
 
245 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  43.56 
 
 
252 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  43.56 
 
 
252 aa  62  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.61 
 
 
238 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.92 
 
 
242 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.61 
 
 
239 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.13 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
244 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.78 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  43.56 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  40.38 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  38.14 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  37.97 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 
634 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.43 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.45 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  38.24 
 
 
312 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.1 
 
 
243 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  33.55 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
265 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
1162 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.1 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.38 
 
 
345 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.59 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.12 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
309 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>