74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1252 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  100 
 
 
305 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  37.45 
 
 
1476 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3998  methyltransferase type 11  28.9 
 
 
322 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  39.47 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 
511 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1117  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39297  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  30.89 
 
 
239 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  40.91 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  27.56 
 
 
216 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
239 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
706 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0406  methyltransferase type 11  30.67 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.109982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3647  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
242 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3940  Methyltransferase type 11  32.64 
 
 
242 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
324 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  35.21 
 
 
227 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  37.11 
 
 
233 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28 
 
 
232 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  39.73 
 
 
311 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2045  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
358 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3644  methyltransferase type 11  38.36 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  46.81 
 
 
211 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
254 aa  47  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  42.86 
 
 
238 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3807  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 
262 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  32.61 
 
 
245 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3339  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52136  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  37.18 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.96 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  40 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
205 aa  44.3  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 
201 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  38.67 
 
 
249 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 
207 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
233 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0883  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.049134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1986  methyltransferase type 11  40.38 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.110241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1678  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
242 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4065  methyltransferase type 11  41.51 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  0.0815821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  38.78 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 
207 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  47.62 
 
 
258 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  38.03 
 
 
246 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  48 
 
 
229 aa  43.5  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3264  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
237 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.58 
 
 
262 aa  43.1  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2562  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
227 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000154268  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
197 aa  43.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
282 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
246 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
264 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  42 
 
 
870 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
239 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.02 
 
 
420 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
245 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.22 
 
 
237 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 
225 aa  42.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>