More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0611 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0585  methyltransferase type 11  91.07 
 
 
224 aa  430  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356128  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_550  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  91.07 
 
 
224 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00760121  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1459  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 
190 aa  82  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  30.97 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.76 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  38.46 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05119  tRNA methyltransferase (Eurofung)  32.35 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.21 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  33.98 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.71 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  39.8 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36712  predicted protein  29.21 
 
 
246 aa  63.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.214896  hitchhiker  0.00091812 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3224  Methyltransferase type 11  28.05 
 
 
275 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.156136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41621  predicted protein  29.21 
 
 
246 aa  63.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0117429 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
207 aa  62.4  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32 
 
 
257 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  30 
 
 
290 aa  62  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  34.53 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  30.12 
 
 
249 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  28.32 
 
 
207 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.89 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  27.1 
 
 
312 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.25 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 
213 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  26.29 
 
 
254 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  32.45 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  24.76 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
348 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
203 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
339 aa  59.3  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
239 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.69 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
239 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
284 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
286 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  30.19 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  30.19 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  30.11 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.29 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2530  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.75 
 
 
256 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.38 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  27.51 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  30.19 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2566  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  37.62 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.96 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  33.57 
 
 
390 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2782  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320592  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  28.12 
 
 
353 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.75 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.96 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.73 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.73 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
295 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.93 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.96 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  30.97 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.96 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  29.56 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  29.56 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
256 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  26.44 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
268 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.04 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
285 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
268 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
276 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
271 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53251  tRNA methyltransferase, has a role in tRNA modification  29.84 
 
 
259 aa  55.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.26394 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  32.85 
 
 
285 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.2 
 
 
256 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  28.12 
 
 
353 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  30.19 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  34.26 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>