22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1767 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1767  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 350 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2379  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 350 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3969  phytanoyl-CoA dioxygenase  48.64 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1647  Phytanoyl-CoA dioxygenase  39.66 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6245  Phytanoyl-CoA dioxygenase  37.58 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5063  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.42 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15519  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5986  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.48 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0323  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.78 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  55 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.13 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3043  hypothetical protein  55 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000591502  hitchhiker  0.0000218626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.68 
 
 		 271 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  57.14 
 
 		 2796 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  27.75 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.56 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  59.38 
 
 		 1806 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  59.38 
 
 		 1632 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  37.8 
 
 		 668 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  20.93 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5428  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.08 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0395279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  57.14 
 
 		 2342 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  57.14 
 
 		 2342 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>