77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3709 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 		 746 aa  90.5  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  57.33 
 
 		 115 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  54.79 
 
 		 120 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  54.17 
 
 		 1632 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  54.17 
 
 		 1806 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  48.75 
 
 		 849 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  56.34 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  56 
 
 		 680 aa  83.2  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  51.39 
 
 		 2342 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  51.39 
 
 		 2342 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  45.21 
 
 		 1152 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  45.21 
 
 		 1152 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  56.34 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 		 1067 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  45.98 
 
 		 644 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  42.35 
 
 		 665 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  48.65 
 
 		 756 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  44.33 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  53.52 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  42.48 
 
 		 1044 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  52.11 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  39.77 
 
 		 872 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  45.59 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 857 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  54.05 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  54.05 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  41.67 
 
 		 2796 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 1247 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  46.48 
 
 		 355 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 		 1476 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  54.05 
 
 		 361 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  43.06 
 
 		 521 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  43.66 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.38 
 
 		 1162 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 1264 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  42.53 
 
 		 1322 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  43.37 
 
 		 1313 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  36.23 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  41.18 
 
 		 1366 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  37.14 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 		 1317 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 814 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  39.24 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  47.3 
 
 		 995 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  37.84 
 
 		 678 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  38.83 
 
 		 1302 aa  59.3  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1185  hypothetical protein  32.41 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  49.21 
 
 		 597 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  45.95 
 
 		 1059 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  45.95 
 
 		 1035 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  40.96 
 
 		 916 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  37.18 
 
 		 751 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  37.18 
 
 		 751 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  34.44 
 
 		 1161 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40 
 
 		 418 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  38.78 
 
 		 1313 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  35.29 
 
 		 305 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 882 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  35.51 
 
 		 830 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  36.21 
 
 		 513 aa  50.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  37.31 
 
 		 399 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  48.15 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3867  hypothetical protein  51.22 
 
 		 296 aa  48.9  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 		 987 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  46.27 
 
 		 668 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  40.3 
 
 		 1301 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  31.82 
 
 		 462 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  32.71 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  38.55 
 
 		 801 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 846 aa  45.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1880 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  37.14 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 461 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  37.04 
 
 		 603 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 		 1236 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  32.91 
 
 		 736 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>