66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3017 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  649    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  61.9 
 
 		 137 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  61.9 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  61.9 
 
 		 137 aa  116  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4776  GDSL family lipase  39.18 
 
 		 242 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  56.25 
 
 		 644 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  56.41 
 
 		 115 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  55.13 
 
 		 120 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  50 
 
 		 355 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  52.81 
 
 		 227 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1350  GDSL family lipase  37.43 
 
 		 252 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0452  hypothetical protein  36.63 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.564727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  44.33 
 
 		 1806 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  49.32 
 
 		 1632 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  53.42 
 
 		 680 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  49.32 
 
 		 2342 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  49.32 
 
 		 2342 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  47.44 
 
 		 1264 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  42.86 
 
 		 2796 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  44.57 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  36.43 
 
 		 592 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  62 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  62 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  41.49 
 
 		 665 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  37.4 
 
 		 849 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  56.86 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  43.66 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  44.09 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  44.74 
 
 		 678 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 1152 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 1152 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  43.66 
 
 		 814 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 		 872 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  44.09 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  45.71 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  53.06 
 
 		 1067 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  46.77 
 
 		 857 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  44.09 
 
 		 294 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  36 
 
 		 1161 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  38.16 
 
 		 746 aa  56.6  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  50 
 
 		 1059 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 1035 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  46.05 
 
 		 995 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  36.96 
 
 		 1162 aa  52.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 		 756 aa  52.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 1313 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  44.29 
 
 		 1044 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 		 987 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  40 
 
 		 751 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  40 
 
 		 751 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 		 1322 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  31.53 
 
 		 597 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 		 1317 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  41.1 
 
 		 1476 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  35.71 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.31 
 
 		 1366 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 1247 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  38.55 
 
 		 2296 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1880 aa  46.2  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2480  hypothetical protein  44.64 
 
 		 143 aa  46.2  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.696042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3043  hypothetical protein  54.55 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000591502  hitchhiker  0.0000218626 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  32.1 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  33.87 
 
 		 518 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  37.5 
 
 		 513 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  33.62 
 
 		 830 aa  43.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  26.81 
 
 		 235 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>