103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2010 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  100 
 
 		 678 aa  1404    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3985  hypothetical protein  35.99 
 
 		 488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3920  hypothetical protein  47.03 
 
 		 452 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4089  hypothetical protein  47.03 
 
 		 452 aa  195  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.180938 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3441  hypothetical protein  43.5 
 
 		 469 aa  191  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.061635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3314  hypothetical protein  33 
 
 		 423 aa  187  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0545287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1528  hypothetical protein  31.66 
 
 		 591 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4285  hypothetical protein  31.48 
 
 		 278 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0807349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  25.19 
 
 		 1182 aa  129  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0298  hypothetical protein  28.68 
 
 		 339 aa  127  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  35.59 
 
 		 399 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  27.73 
 
 		 746 aa  121  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  46.61 
 
 		 2342 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  46.61 
 
 		 2342 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 		 673 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  51.61 
 
 		 2796 aa  109  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  47.79 
 
 		 361 aa  102  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  42.24 
 
 		 746 aa  100  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2926  hypothetical protein  35.67 
 
 		 430 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0168405  normal  0.78979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  40.8 
 
 		 849 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  47.79 
 
 		 361 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  52.63 
 
 		 361 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2476  hypothetical protein  33.85 
 
 		 294 aa  95.1  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  46.67 
 
 		 1632 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  46.67 
 
 		 1806 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0853  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.18 
 
 		 418 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  42.74 
 
 		 518 aa  92  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0903  hypothetical protein  27.66 
 
 		 326 aa  90.5  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  38.58 
 
 		 1152 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  38.58 
 
 		 1152 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  50 
 
 		 592 aa  88.2  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  35.57 
 
 		 521 aa  87.4  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  50.62 
 
 		 120 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 		 857 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  50.62 
 
 		 115 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 1239 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  38.95 
 
 		 872 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  52.7 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  36.57 
 
 		 1067 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 1185 aa  76.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 		 535 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  48.68 
 
 		 644 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.04 
 
 		 1366 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  44.57 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  47.22 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  47.95 
 
 		 680 aa  72.4  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  43.48 
 
 		 294 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  45.83 
 
 		 665 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  46.75 
 
 		 1264 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  45.56 
 
 		 137 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  40.35 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  46.67 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3097  hypothetical protein  27.31 
 
 		 358 aa  70.5  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  46.67 
 
 		 137 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0457  hypothetical protein  26.52 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 756 aa  68.2  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3316  hypothetical protein  23.91 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.139643  normal  0.280359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  44.16 
 
 		 814 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 1044 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  25.58 
 
 		 786 aa  64.7  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  35.96 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  44.74 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1249  chromosome segregation ATPase-like protein  25.97 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  28.05 
 
 		 1209 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  44.29 
 
 		 987 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1880 aa  62  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  42.03 
 
 		 1247 aa  61.6  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 		 1317 aa  62  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  42.86 
 
 		 1161 aa  61.6  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  39.24 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  40 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2186  hypothetical protein  26.52 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  37.84 
 
 		 255 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  40.54 
 
 		 1476 aa  59.7  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  31.67 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46979  predicted protein  27.9 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.35 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  47.62 
 
 		 1035 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  47.62 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  42.65 
 
 		 995 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0030  hypothetical protein  26.27 
 
 		 222 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3103  hypothetical protein  30.83 
 
 		 268 aa  57  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 1322 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  39.19 
 
 		 1302 aa  55.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  36.84 
 
 		 1162 aa  55.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  38.2 
 
 		 830 aa  54.7  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0125  hypothetical protein  28.66 
 
 		 289 aa  54.3  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.123999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4582  hypothetical protein  26.15 
 
 		 362 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 		 1301 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.29 
 
 		 916 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5382  hypothetical protein  30.25 
 
 		 276 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 		 1313 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  23.78 
 
 		 769 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 		 846 aa  47.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1313 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  35.8 
 
 		 603 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 882 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0141  hypothetical protein  24.65 
 
 		 269 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2636  hypothetical protein  28.67 
 
 		 258 aa  45.8  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0044335  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  36.14 
 
 		 223 aa  45.8  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>