71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4982 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  97.81 
 
 		 137 aa  249  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  83.94 
 
 		 137 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  61.9 
 
 		 322 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  56.57 
 
 		 115 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  54.81 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  58.7 
 
 		 227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  62.03 
 
 		 355 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  51.69 
 
 		 644 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  47.83 
 
 		 521 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  56.34 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  50 
 
 		 1806 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  52.05 
 
 		 680 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  49.35 
 
 		 2796 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  50.65 
 
 		 2342 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  50 
 
 		 849 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  48.75 
 
 		 1632 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  50.65 
 
 		 2342 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  45.57 
 
 		 746 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  44.58 
 
 		 872 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  40 
 
 		 592 aa  70.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  46.67 
 
 		 678 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  51.61 
 
 		 857 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  42.55 
 
 		 1067 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 1152 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 1152 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  51.95 
 
 		 361 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  51.95 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 665 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  46.15 
 
 		 1264 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  45.98 
 
 		 995 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  45.21 
 
 		 814 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  48.05 
 
 		 361 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 		 756 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 		 535 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  40.51 
 
 		 1366 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 1322 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  45.71 
 
 		 1044 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  40 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  45.1 
 
 		 1161 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  44.05 
 
 		 1059 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  41.77 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  39.33 
 
 		 597 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  43.04 
 
 		 294 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.69 
 
 		 916 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  47.06 
 
 		 1162 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 		 1476 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  35.58 
 
 		 751 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  48.44 
 
 		 1035 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  35.58 
 
 		 751 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 1247 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  43.04 
 
 		 294 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 		 1302 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  37.66 
 
 		 518 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2480  hypothetical protein  34.45 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.696042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  36.08 
 
 		 1317 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 1313 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  43.66 
 
 		 1301 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1880 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  46.15 
 
 		 305 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  39.36 
 
 		 830 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 		 987 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  40.24 
 
 		 462 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  39.02 
 
 		 1313 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  54.55 
 
 		 461 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0291  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 740 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0775  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 740 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  34.78 
 
 		 1805 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  34.52 
 
 		 2296 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 		 1236 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  35.71 
 
 		 223 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>