157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0558 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  100 
 
 		 1880 aa  3628    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  39.61 
 
 		 830 aa  89.4  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  41.73 
 
 		 1313 aa  84.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  33.46 
 
 		 728 aa  72.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  41.12 
 
 		 1632 aa  72  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  32.25 
 
 		 739 aa  71.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  41.12 
 
 		 1806 aa  70.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  35.66 
 
 		 849 aa  70.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 		 746 aa  69.7  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  37.69 
 
 		 361 aa  68.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  38.32 
 
 		 2342 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  39.81 
 
 		 2342 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  39.06 
 
 		 361 aa  66.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  32.97 
 
 		 742 aa  66.6  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  33.46 
 
 		 692 aa  65.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  38.28 
 
 		 361 aa  65.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  31.08 
 
 		 521 aa  65.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  30.84 
 
 		 1286 aa  64.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  32.19 
 
 		 595 aa  64.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  31.33 
 
 		 1532 aa  63.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 857 aa  63.2  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  30.61 
 
 		 1534 aa  62.8  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  32.58 
 
 		 678 aa  62  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  33.19 
 
 		 2954 aa  62  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  28.28 
 
 		 736 aa  61.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 1152 aa  61.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  36.45 
 
 		 2796 aa  61.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  37.27 
 
 		 227 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.73 
 
 		 1963 aa  60.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01251  hypothetical protein  27.59 
 
 		 531 aa  60.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.430243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 		 872 aa  60.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  36.44 
 
 		 2296 aa  60.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  32.7 
 
 		 1287 aa  60.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  28.89 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3869  Ca 2+ binding protein  26.53 
 
 		 1572 aa  59.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  38.26 
 
 		 572 aa  59.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  38.16 
 
 		 1152 aa  59.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  32.5 
 
 		 606 aa  59.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  43.48 
 
 		 644 aa  59.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.33 
 
 		 1363 aa  59.3  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  36.55 
 
 		 3619 aa  59.3  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  28.65 
 
 		 959 aa  58.9  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.04 
 
 		 3619 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.33 
 
 		 2667 aa  58.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  27.85 
 
 		 294 aa  58.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  33.77 
 
 		 597 aa  58.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  27.51 
 
 		 682 aa  57.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  29.55 
 
 		 518 aa  57.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  27.14 
 
 		 1805 aa  57  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  26.85 
 
 		 1217 aa  57.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0469  hypothetical protein  32.94 
 
 		 458 aa  57.4  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000719923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.78 
 
 		 3427 aa  57.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  28.71 
 
 		 724 aa  57.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  28.38 
 
 		 294 aa  57.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  37.28 
 
 		 946 aa  57  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  33.7 
 
 		 357 aa  56.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 		 1067 aa  56.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  29.1 
 
 		 294 aa  56.2  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  33.63 
 
 		 115 aa  56.2  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  30.42 
 
 		 589 aa  55.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  34.01 
 
 		 950 aa  56.2  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  34.44 
 
 		 744 aa  55.5  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  29.97 
 
 		 1019 aa  55.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35 
 
 		 1027 aa  55.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  33.55 
 
 		 613 aa  55.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 535 aa  55.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  35.16 
 
 		 120 aa  55.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1287  VCBS  34.74 
 
 		 610 aa  54.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.535504  normal  0.448224 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.18 
 
 		 1279 aa  54.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  28.62 
 
 		 623 aa  54.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.72 
 
 		 588 aa  54.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  30 
 
 		 1366 aa  53.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 491 aa  53.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  34.38 
 
 		 396 aa  53.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  28.87 
 
 		 305 aa  53.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  29.39 
 
 		 526 aa  53.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  29.39 
 
 		 424 aa  53.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  28.38 
 
 		 14829 aa  53.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  31.68 
 
 		 1112 aa  53.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  38.71 
 
 		 137 aa  53.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.22 
 
 		 826 aa  53.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  34.9 
 
 		 260 aa  53.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  34.88 
 
 		 245 aa  53.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  28.35 
 
 		 518 aa  53.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 756 aa  52.4  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 		 665 aa  52.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  34.38 
 
 		 1844 aa  52.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 		 846 aa  52.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.43 
 
 		 980 aa  52.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  36.55 
 
 		 232 aa  52  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  32 
 
 		 734 aa  52  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  28.98 
 
 		 4334 aa  52  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  50 
 
 		 603 aa  51.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  32.63 
 
 		 833 aa  52  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20961  hemolysin-type calcium-binding domain-containing protein  30.95 
 
 		 2082 aa  51.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  36.05 
 
 		 375 aa  52  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.49 
 
 		 1400 aa  51.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  31.48 
 
 		 462 aa  50.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  33.47 
 
 		 2145 aa  51.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  28.1 
 
 		 15831 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>