114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3869 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3869  Ca 2+ binding protein  100 
 
 		 1572 aa  2924    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385063  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  26.6 
 
 		 1217 aa  115  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4160  VCBS  27 
 
 		 6581 aa  113  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.530259 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  27.05 
 
 		 1400 aa  102  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  25.89 
 
 		 2097 aa  86.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  29.45 
 
 		 2911 aa  85.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  28.87 
 
 		 946 aa  79.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  27.23 
 
 		 589 aa  77.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  32.84 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  26.38 
 
 		 1079 aa  73.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  26.65 
 
 		 15831 aa  72.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  31.86 
 
 		 479 aa  70.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  24.64 
 
 		 1072 aa  69.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  24.97 
 
 		 4334 aa  67.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  28.92 
 
 		 475 aa  67  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  26.48 
 
 		 860 aa  65.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  40.31 
 
 		 490 aa  64.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  28.07 
 
 		 476 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  23.51 
 
 		 1628 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  32.46 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  25.86 
 
 		 1421 aa  63.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  28.9 
 
 		 14829 aa  62  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  35.51 
 
 		 480 aa  61.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  34.31 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  32.67 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  26.11 
 
 		 1582 aa  59.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  35.25 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  26.86 
 
 		 1363 aa  58.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  28.47 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  25.51 
 
 		 959 aa  58.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  32.97 
 
 		 759 aa  57.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  26.34 
 
 		 556 aa  56.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  27.03 
 
 		 1499 aa  56.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1880 aa  56.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  32.75 
 
 		 221 aa  55.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  32.8 
 
 		 621 aa  55.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  32.8 
 
 		 621 aa  55.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1054  hypothetical protein  28.06 
 
 		 527 aa  55.5  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  32.47 
 
 		 504 aa  55.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  35.62 
 
 		 474 aa  55.5  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  28.7 
 
 		 692 aa  55.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01251  hypothetical protein  30.89 
 
 		 531 aa  55.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.430243 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  29.06 
 
 		 559 aa  54.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  30.89 
 
 		 357 aa  55.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  23.38 
 
 		 2107 aa  55.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0112  hypothetical protein  25.59 
 
 		 677 aa  53.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0954339  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  26.8 
 
 		 537 aa  52.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  25.83 
 
 		 1787 aa  52.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  24.4 
 
 		 1390 aa  52.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  31.94 
 
 		 515 aa  52.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  39.55 
 
 		 462 aa  52.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  30.77 
 
 		 442 aa  52.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  30.77 
 
 		 444 aa  52  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  26.84 
 
 		 1145 aa  52  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  32.59 
 
 		 1883 aa  52  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  30.77 
 
 		 444 aa  52  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  29.24 
 
 		 468 aa  51.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  29.02 
 
 		 1286 aa  51.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  32.14 
 
 		 677 aa  51.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  34.58 
 
 		 768 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  24.54 
 
 		 1156 aa  50.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  32.18 
 
 		 1610 aa  51.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  33.56 
 
 		 998 aa  51.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  29.12 
 
 		 2467 aa  50.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  38.04 
 
 		 856 aa  50.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0004  hypothetical protein  27.61 
 
 		 414 aa  50.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  28.9 
 
 		 2198 aa  50.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  23.75 
 
 		 2245 aa  50.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 2336 aa  50.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  29.06 
 
 		 202 aa  50.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  25.36 
 
 		 795 aa  49.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  29.06 
 
 		 202 aa  50.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.81 
 
 		 2678 aa  50.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.62 
 
 		 1415 aa  50.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  26.78 
 
 		 1855 aa  49.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  27.87 
 
 		 595 aa  49.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  36.79 
 
 		 260 aa  49.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  39.29 
 
 		 385 aa  49.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  33.56 
 
 		 340 aa  49.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  28 
 
 		 682 aa  48.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  39.74 
 
 		 1839 aa  48.9  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  32.75 
 
 		 889 aa  48.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.85 
 
 		 6683 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  35.85 
 
 		 6662 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  25.82 
 
 		 3954 aa  48.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  35.85 
 
 		 6779 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  29.48 
 
 		 965 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  23.78 
 
 		 4800 aa  48.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  40.74 
 
 		 7679 aa  47.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  26.92 
 
 		 303 aa  47.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  26.46 
 
 		 387 aa  47.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  26.4 
 
 		 1279 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  28.14 
 
 		 2775 aa  47.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  35.71 
 
 		 858 aa  47.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.85 
 
 		 2239 aa  47  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  28.67 
 
 		 2105 aa  46.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  32.2 
 
 		 2701 aa  47  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  33.61 
 
 		 901 aa  47  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  25.16 
 
 		 764 aa  47  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  33.54 
 
 		 1610 aa  46.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>