220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20961 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_20961  hemolysin-type calcium-binding domain-containing protein  100 
 
 
2082 aa  4021    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  54.55 
 
 
1526 aa  77.4  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  29.41 
 
 
589 aa  68.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  38.82 
 
 
2667 aa  68.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  33.86 
 
 
475 aa  67  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 
475 aa  66.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  36.21 
 
 
680 aa  63.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  33.33 
 
 
1844 aa  63.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  40.15 
 
 
2885 aa  63.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  38.53 
 
 
437 aa  62.4  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  51.56 
 
 
781 aa  62.4  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  39.45 
 
 
437 aa  62  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  33.19 
 
 
742 aa  62  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
729 aa  62  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  37.06 
 
 
4334 aa  61.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  43.56 
 
 
4798 aa  60.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  45.63 
 
 
744 aa  61.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  34.65 
 
 
4723 aa  61.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  33.17 
 
 
1895 aa  61.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  34.24 
 
 
534 aa  60.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  34.42 
 
 
9867 aa  60.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  37.95 
 
 
202 aa  60.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  37.95 
 
 
202 aa  60.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  46.74 
 
 
982 aa  60.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  48.15 
 
 
950 aa  60.1  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  37.6 
 
 
546 aa  60.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  32.67 
 
 
3619 aa  59.7  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  32.67 
 
 
3619 aa  59.3  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  47.06 
 
 
2336 aa  59.7  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  42.06 
 
 
767 aa  59.3  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  36.73 
 
 
572 aa  58.9  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  47.71 
 
 
1287 aa  58.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  32.14 
 
 
724 aa  58.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  40.62 
 
 
942 aa  58.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.02 
 
 
2911 aa  57.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  27.3 
 
 
460 aa  58.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  32.71 
 
 
739 aa  57.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  34.13 
 
 
1424 aa  58.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  34.78 
 
 
2342 aa  57.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  40.4 
 
 
582 aa  57.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.44 
 
 
3427 aa  57.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  34.78 
 
 
2342 aa  57.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  50.85 
 
 
4678 aa  57.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  40.4 
 
 
585 aa  57  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.2 
 
 
1553 aa  57.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.68 
 
 
2678 aa  56.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  51.47 
 
 
1864 aa  56.6  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.86 
 
 
1236 aa  56.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  33.67 
 
 
639 aa  56.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2542  Hemolysin-type calcium-binding region  38.95 
 
 
485 aa  56.2  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  39.45 
 
 
3598 aa  56.2  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  45.88 
 
 
3608 aa  56.2  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  30 
 
 
1534 aa  56.2  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.16 
 
 
1027 aa  56.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.95 
 
 
1164 aa  56.2  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  41.09 
 
 
867 aa  56.2  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  49.32 
 
 
1421 aa  56.2  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  42.31 
 
 
2178 aa  56.2  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  35.66 
 
 
615 aa  55.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.71 
 
 
36805 aa  55.8  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2989  hemolysin-type calcium-binding region  50.88 
 
 
2469 aa  55.8  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  43.02 
 
 
1757 aa  55.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  36.02 
 
 
2775 aa  55.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.67 
 
 
1279 aa  55.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  30.88 
 
 
946 aa  55.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  53.16 
 
 
2245 aa  55.5  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.77 
 
 
4836 aa  54.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  45.3 
 
 
396 aa  54.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 
826 aa  54.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  35.04 
 
 
736 aa  54.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
1372 aa  54.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  40.91 
 
 
561 aa  54.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  31.32 
 
 
692 aa  53.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  34.06 
 
 
768 aa  54.3  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  37.23 
 
 
485 aa  54.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
792 aa  54.3  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  31.51 
 
 
795 aa  53.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  38.69 
 
 
357 aa  53.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  47.3 
 
 
1197 aa  53.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  45.95 
 
 
260 aa  53.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  32.24 
 
 
2105 aa  54.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  38.3 
 
 
1055 aa  53.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  30.41 
 
 
709 aa  53.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.74 
 
 
577 aa  53.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  30.6 
 
 
460 aa  53.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  40.74 
 
 
1019 aa  52.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3855  Hemolysin-type calcium-binding region  32.69 
 
 
472 aa  52.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.52 
 
 
1963 aa  53.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  33.68 
 
 
540 aa  52.8  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  37.04 
 
 
1502 aa  52.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  31.36 
 
 
303 aa  52.4  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0597  Hemolysin-type calcium-binding region  25.9 
 
 
546 aa  52.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.845183  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  48.28 
 
 
2542 aa  52  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  41.86 
 
 
1145 aa  52  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  38.71 
 
 
504 aa  51.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3265  sulfatase  30.89 
 
 
770 aa  52  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  30.05 
 
 
510 aa  51.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  35.65 
 
 
3587 aa  52  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  31.22 
 
 
728 aa  52  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  33.68 
 
 
540 aa  52  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>