More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2989 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2988  hemolysin-type calcium-binding region  89.58 
 
 		 4519 aa  2986    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2989  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 2469 aa  4614    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  35.88 
 
 		 1121 aa  132  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2686  lipase, class 3  53.52 
 
 		 617 aa  68.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.458877  unclonable  0.0000292693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  55 
 
 		 1019 aa  63.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  40.91 
 
 		 417 aa  63.9  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  50.72 
 
 		 1839 aa  63.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24577  predicted protein  23.67 
 
 		 1676 aa  63.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0561517  normal  0.0448283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  45.26 
 
 		 1403 aa  63.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3984  hypothetical protein  24.89 
 
 		 742 aa  62.8  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580722  hitchhiker  0.00476383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  35.56 
 
 		 1499 aa  62.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 243 aa  62  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  40.74 
 
 		 1346 aa  62.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  45.35 
 
 		 622 aa  61.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  56.67 
 
 		 2807 aa  61.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  52.24 
 
 		 998 aa  61.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.58 
 
 		 1052 aa  62  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  52.38 
 
 		 547 aa  60.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  63.27 
 
 		 1112 aa  60.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  51.76 
 
 		 3314 aa  60.5  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.11 
 
 		 2678 aa  60.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  57.63 
 
 		 2198 aa  60.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.82 
 
 		 485 aa  60.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  58.62 
 
 		 1055 aa  60.1  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.57 
 
 		 2346 aa  60.1  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  44.55 
 
 		 833 aa  59.7  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  57.69 
 
 		 4285 aa  59.7  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  51.72 
 
 		 2567 aa  59.7  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  48.68 
 
 		 3209 aa  59.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  43.24 
 
 		 2125 aa  59.7  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.23 
 
 		 5962 aa  59.7  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  51.52 
 
 		 1526 aa  59.3  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  50.75 
 
 		 998 aa  59.3  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  54.39 
 
 		 8682 aa  58.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  49.32 
 
 		 421 aa  58.9  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.79 
 
 		 588 aa  58.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  60.78 
 
 		 1610 aa  58.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  37.21 
 
 		 926 aa  57.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  54.55 
 
 		 2667 aa  58.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  37.61 
 
 		 375 aa  58.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  50.91 
 
 		 795 aa  57.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  39.18 
 
 		 537 aa  58.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  47.14 
 
 		 652 aa  58.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  49.12 
 
 		 2784 aa  58.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  54.84 
 
 		 4687 aa  58.2  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.15 
 
 		 2668 aa  57.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  51.61 
 
 		 5218 aa  57.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  52.17 
 
 		 4723 aa  57.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  48.15 
 
 		 1895 aa  57.4  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  52.63 
 
 		 9030 aa  57.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  54.24 
 
 		 1306 aa  57.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.06 
 
 		 1372 aa  57.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  52.83 
 
 		 4106 aa  57.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  49.3 
 
 		 3954 aa  57.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  54.39 
 
 		 2542 aa  57  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  52.54 
 
 		 460 aa  57  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  38.39 
 
 		 1480 aa  57.4  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  46.91 
 
 		 621 aa  57  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  34.19 
 
 		 517 aa  57  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.58 
 
 		 3427 aa  57.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  50.91 
 
 		 373 aa  56.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0833  hemolysin-type calcium-binding region  40.74 
 
 		 571 aa  57  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  45.21 
 
 		 686 aa  57  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  54.1 
 
 		 9867 aa  57  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  46.67 
 
 		 709 aa  57  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 851 aa  56.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  53.57 
 
 		 6753 aa  56.6  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  41.86 
 
 		 727 aa  56.2  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  38.35 
 
 		 7284 aa  56.2  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  65.12 
 
 		 1532 aa  56.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  37.93 
 
 		 1502 aa  56.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  48.68 
 
 		 1883 aa  56.2  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  55.17 
 
 		 767 aa  55.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  53.85 
 
 		 1145 aa  55.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.18 
 
 		 2239 aa  55.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  46.91 
 
 		 2336 aa  55.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  44.78 
 
 		 491 aa  55.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  46.67 
 
 		 16322 aa  55.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  61.54 
 
 		 2885 aa  55.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  50.85 
 
 		 781 aa  55.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 2704 aa  55.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  32.18 
 
 		 3026 aa  55.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  47.76 
 
 		 1166 aa  55.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  49.18 
 
 		 219 aa  55.5  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  51.61 
 
 		 938 aa  55.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  38.05 
 
 		 1121 aa  55.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  50.98 
 
 		 1111 aa  55.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  42.72 
 
 		 2954 aa  55.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  49.15 
 
 		 245 aa  55.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.94 
 
 		 547 aa  55.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  37.66 
 
 		 678 aa  55.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  46.55 
 
 		 982 aa  55.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  48.21 
 
 		 1287 aa  55.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  55.93 
 
 		 1421 aa  55.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  31.4 
 
 		 535 aa  55.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  55.77 
 
 		 855 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  46.67 
 
 		 999 aa  54.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  44.71 
 
 		 1202 aa  55.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  48.65 
 
 		 518 aa  55.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  36.54 
 
 		 5185 aa  54.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>