More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3993 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  100 
 
 		 1112 aa  2167    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  75.72 
 
 		 1112 aa  1634    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  37.67 
 
 		 2911 aa  189  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  33.76 
 
 		 820 aa  182  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  35.31 
 
 		 1544 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29 
 
 		 1415 aa  174  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  38.19 
 
 		 1079 aa  171  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  37.64 
 
 		 1884 aa  170  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  28.44 
 
 		 1133 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  33.45 
 
 		 4800 aa  164  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  34.3 
 
 		 745 aa  162  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  28.34 
 
 		 1134 aa  161  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  32.17 
 
 		 574 aa  146  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  38.53 
 
 		 833 aa  145  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.56 
 
 		 1390 aa  142  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  34.28 
 
 		 764 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.01 
 
 		 1145 aa  132  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.43 
 
 		 2678 aa  129  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  37.81 
 
 		 2836 aa  128  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  33.25 
 
 		 531 aa  128  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  33 
 
 		 531 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  28.65 
 
 		 1286 aa  127  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  27.8 
 
 		 727 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 		 1072 aa  126  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  28.03 
 
 		 3954 aa  124  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  28.91 
 
 		 648 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  30.33 
 
 		 614 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  31.58 
 
 		 1582 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  43.72 
 
 		 759 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  40.07 
 
 		 4687 aa  121  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  52.94 
 
 		 1029 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  52.94 
 
 		 1029 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34.8 
 
 		 3619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  30.98 
 
 		 1628 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  31.43 
 
 		 795 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  35.51 
 
 		 3619 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  30.31 
 
 		 4334 aa  119  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  32.51 
 
 		 769 aa  118  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  31.51 
 
 		 1534 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  27.96 
 
 		 1764 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  37.85 
 
 		 556 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  32.54 
 
 		 1213 aa  116  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.2 
 
 		 1279 aa  114  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  31.16 
 
 		 3209 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  31.2 
 
 		 595 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  32.09 
 
 		 2950 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.21 
 
 		 1363 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  30.17 
 
 		 2467 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  33.59 
 
 		 2097 aa  111  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  30.05 
 
 		 535 aa  111  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  28.96 
 
 		 535 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  30.37 
 
 		 1855 aa  110  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  31.61 
 
 		 1532 aa  109  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  36.09 
 
 		 1424 aa  108  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  34.16 
 
 		 2954 aa  108  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.6 
 
 		 2105 aa  106  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.57 
 
 		 2807 aa  105  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  29.06 
 
 		 2133 aa  105  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.94 
 
 		 946 aa  105  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  36.71 
 
 		 2775 aa  105  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  48.53 
 
 		 462 aa  105  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  32.31 
 
 		 490 aa  104  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  30.91 
 
 		 785 aa  102  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  29.89 
 
 		 480 aa  101  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  29.62 
 
 		 486 aa  101  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  34.26 
 
 		 504 aa  101  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  30.33 
 
 		 476 aa  101  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  32.11 
 
 		 833 aa  101  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.09 
 
 		 1795 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.08 
 
 		 980 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  41.23 
 
 		 3608 aa  101  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  37.1 
 
 		 534 aa  100  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  31.06 
 
 		 474 aa  100  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  31.45 
 
 		 1499 aa  99.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  32.38 
 
 		 1864 aa  99.8  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.36 
 
 		 3427 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  33.72 
 
 		 1164 aa  99.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  49.26 
 
 		 448 aa  99  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  31.56 
 
 		 1631 aa  98.2  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  29.75 
 
 		 476 aa  97.8  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  29.6 
 
 		 606 aa  97.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  31.31 
 
 		 479 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.88 
 
 		 1400 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  29.18 
 
 		 475 aa  95.9  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.92 
 
 		 2689 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  29.18 
 
 		 1156 aa  95.1  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  29.28 
 
 		 451 aa  94.7  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  34.41 
 
 		 387 aa  94  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  30.72 
 
 		 481 aa  94.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  48.18 
 
 		 357 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  31.25 
 
 		 444 aa  92.8  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  29.34 
 
 		 824 aa  92.8  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  34.19 
 
 		 526 aa  93.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  33.19 
 
 		 479 aa  92.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  30.9 
 
 		 442 aa  92.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  29.65 
 
 		 2667 aa  92  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  41.25 
 
 		 1971 aa  92  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  32.62 
 
 		 1883 aa  90.9  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  30.72 
 
 		 444 aa  89.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  32.71 
 
 		 965 aa  90.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>