37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0876 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  100 
 
 
1121 aa  2119    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2988  hemolysin-type calcium-binding region  35.23 
 
 
4519 aa  169  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2989  hemolysin-type calcium-binding region  34.78 
 
 
2469 aa  164  9e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.45 
 
 
862 aa  84.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1128  hypothetical protein  34.96 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  34.88 
 
 
2178 aa  70.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  33.98 
 
 
1037 aa  65.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  32.04 
 
 
615 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  27.37 
 
 
1355 aa  63.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.91 
 
 
464 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  33.93 
 
 
559 aa  63.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  31.13 
 
 
1108 aa  62.4  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  31.48 
 
 
613 aa  62.4  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  33.93 
 
 
485 aa  60.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  32.08 
 
 
502 aa  59.3  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  34.78 
 
 
451 aa  58.9  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  32.14 
 
 
580 aa  58.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  34.23 
 
 
524 aa  58.2  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  29.63 
 
 
700 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  29.23 
 
 
459 aa  57.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  29.25 
 
 
595 aa  56.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  25.45 
 
 
392 aa  55.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  28.3 
 
 
621 aa  54.7  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  31.25 
 
 
564 aa  53.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.36 
 
 
595 aa  53.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  29 
 
 
1584 aa  52.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  37 
 
 
480 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  29.52 
 
 
363 aa  52.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  39.53 
 
 
482 aa  52.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  28.3 
 
 
467 aa  51.6  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  22.22 
 
 
458 aa  51.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1397  hypothetical protein  29.21 
 
 
104 aa  50.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0311355  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  38.95 
 
 
484 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  21.93 
 
 
393 aa  49.3  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  26.73 
 
 
1543 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  29.67 
 
 
2911 aa  47  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  26.73 
 
 
1821 aa  46.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>